对于已经丧失的性功能，良性前列腺增生手术不会使之重新恢复。
对于那些因害怕性欲高潮时出现前列腺疼痛而导致的性功能障碍患者来说，他们常常期望能够通过手术来恢复自己的性功能。随着手术后的逐渐康复以及疼痛症状的逐渐消失，患者的这种不现实的期望将越来越淡化，其精神也会越来越放松。总之一句话，良性前列腺增生的手术治疗只是为了缓解腺体对尿道的压力，它既不能提高患者的勃起功能，也不能使已经丧失的性功能得到恢复。
另外，患者在手术后还将出现一个比较明显的变化——达到性欲高潮时很少甚至根本没有精液射出。不过，有许多患者由于在手术前一直存在逆向射精，所以他们已经习惯了这一现象。随着前列腺的切除，残余前列腺组织所合成分泌的前列腺液将大大减少，而精液绝大部分是由前列腺液组成的，所以手术后出现精液减少的现象其实是很容易理解的。
另外，手术时有时可能需要切断尿道内扩约肌(膀胱底部的一组环状肌肉组织，可以预防性欲高潮时发生精液逆流)，因此射精时精液将逆流至膀胱，这也是导致手术后精液减少的一个原因。总而言之，经尿道前列腺切除术一般不会对患者的性功能造成明显的影响。
尽管前列腺对人类的生殖功能很重要，但是经尿道前列腺切除术不会改变患者的勃起功能。
